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黃捷
副教授(研究員)

基本概況

       黃捷,副教授、研究員、博士生導師、公共衛(wèi)生及應急管理學院應急管理研究中心執(zhí)行主任、華大基因?qū)W院榮譽教授、北京大學全球健康發(fā)展研究院兼職研究員。先后就讀于北京大學公共衛(wèi)生學院(本科)、北京體育大學研究生院(碩士)、密西根大學信息學院(碩士)、北卡羅萊納大學公共衛(wèi)生學院(碩士)、劍橋大學(博士)。 曾任哈佛大學醫(yī)學院講師、美國退伍軍人事務部波士頓榮軍醫(yī)院資深科學家。在國際著名學術期刊發(fā)表文章70余篇,其中包括在《自然》、《自然通訊》、《血液》、《核酸研究》、《生物信息》等國際一流雜志上發(fā)表的第一作者文章。個人著作《基因的名義》一書于2018年由《高等教育出版社》出版,同年入選“中華優(yōu)秀科普圖書榜”。個人著作《核酸大爆炸》一書于2022年由《北京大學出版社》出版。

 

 

研究方向

  1. 全球衛(wèi)生大數(shù)據(jù)研究:針對全球大流行性傳染?。òㄐ鹿诓《痉窝祝┑囊咔榇髷?shù)據(jù)研究,基于傳染病傳播動力學模型的預測和決策研究,基于病原微生物全基因組的系統(tǒng)發(fā)生樹(phylogeny)方法學研究,基于機器學習的病毒三維結構預測研究。

  2. 慢性病決定因素研究:基于大隊列(包括英國 UK Biobank)的系統(tǒng)生物學研究;聚焦心血管疾病、肥胖、老年癡呆癥等全球公共衛(wèi)生重點關注的慢性疾病的全基因組關聯(lián)研究(GWAS)研究、基因風險評估研究(Polygenic Risk Score)。

  3. 個人基因組學研究:個人全基因組測序數(shù)據(jù)深度挖掘,包括對自閉癥和地中海貧血等疾病的生物信息學分析流程和方法創(chuàng)新。

 

 

教育經(jīng)歷

  1. 2012年 1月 - 2015年7月, 英國劍橋大學生物科學博士

  2. 2005年8月 - 2006年8月, 美國北卡大學衛(wèi)生管理學碩士

  3. 1999年9月 - 2002年4月,美國密西根大學信息科學碩士

  4. 1996年9月 – 1999年6月,北京體育大學教育學碩士

  5. 1991年9月 – 1996年6月,北京醫(yī)科大學預防醫(yī)學學士

 

 

工作經(jīng)歷

  1. 2022年3月–至今  南方科技大學公共衛(wèi)生與應急管理學院,副教授、研究員、博士生導師、應急管理研究中心執(zhí)行主任

  2. 2018年6月–2022年2月,北京大學公共衛(wèi)生學院全球衛(wèi)生學系研究員、博士生導師

  3. 2015年6月–2018年4月,美國退伍軍人醫(yī)院波士頓榮軍醫(yī)院資深科學家

  4. 2012年1月–2014年8月,英國桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)資深生物信息分析師

  5. 2009年10月–2012年1月,美國國立衛(wèi)生研究院Framingham Heart Study博士后

  6. 2007年9月–2009年9月,哈佛大學麻省總醫(yī)院人類基因研究中心博士后

  7. 2006年8月 - 2007年8月,美國西北大學醫(yī)學院神經(jīng)疾病研究所資深生物信息分析師,

  8. 2003年8月– 2005年7月,杜克大學醫(yī)學院放射影像中心計算機程序員III

 

 

科研項目

  1. 中國疾病預防控制中心(CDC),“新冠疫情防控策略調(diào)整模型研究方案”。

  2. 科技部重大專項,“多學科視角新冠病毒溯源研究”。

  3. 國家自然科學基金委員會面上項目,“基于大數(shù)據(jù)建模的新冠病毒肺炎疫苗接種策略與政策研究”。

  4. 科技部主動健康和老齡化科技應對重大專項,“營養(yǎng)、運動對老年健康的影響和干預作用”。

  5. 深圳市科創(chuàng)委重大專項,“新冠病毒新變異株疫情深圳防控策略研究”。

  6. 深圳市醫(yī)療衛(wèi)生三名工程高層次醫(yī)學團隊項目,“急救醫(yī)療體系及醫(yī)療優(yōu)先分級調(diào)度系統(tǒng)建設項目”。

  7. 深圳市醫(yī)療衛(wèi)生三名工程高層次醫(yī)學團隊項目,“深圳市自閉癥中心”。

  8. 中國外文局當代中國與世界研究院,“人類衛(wèi)生健康共同體的國際傳播研究”。

  9. 北京大學雙一流建設,“全球衛(wèi)生研究院全球衛(wèi)生大數(shù)據(jù)中心平臺建設”。

 

 

代表性論文(#共同一作,*通訊作者)

  1. Huang J*, McLean GR, Dubee FC, Zheng ZJ, Two Pandemics in China, One Health in Chinese. BMJ Global Health. 2022. April.

  2. Wang M, Wang S, Peng H, Huang J*, Wu T*, Qi L. Arterial stiffness, genetic risk, and type 2 diabetes: a prospective cohort study. Diabetes Care. 2022 April.

  3. Huang J#, Liu J#, Ruiyi Tian, Na Zhang, Hannah Sherman, Patrick Zhuang, Christoph Budjan, Kevin Liu, Michelle Fong, Cullen Clairmont, Minseo Jang, Xue-Jun Kong. A Next Generation Sequencing-Based Protocol for Screening of Variants of Concern in Autism Spectrum Disorder. Cells. 2022

  4. Huang J*, Zhi-Sheng Liang, Stefano Pallotti, Daniel A. King, Zhi-Jie Zheng, Qiang Zhou, Houfeng Zheng, Francesco M. Carpi, Valerio Napolioni*. PAGEANT: Personal access to genome & analysis of natural traits. Nucleic Acids Research. 2021 Dec 20;gkab1245

  5. Huang J*, Pallotti S, Zhou Q, Kleber M, Xin X, King DA, Napolioni V*. PERHAPS: Paired-End short Reads-based HAPlotyping from next-generation Sequencing data. Briefings in Bioinformatics. 2020 Dec 8;bbaa320

  6. Walter K#, Min JL#, Huang J#, Crooks L#. The UK10K project identifies rare variants in health and disease. Nature. 2015 Oct 1;526(7571):82-90.

  7. Huang J#, Howie B, McCarthy S, Memari Y, Walter K, Min JL, Danecek P, Malerba G, Trabetti E, Zheng HF; UK10K Consortium., Gambaro G, Richards JB, Durbin R, Timpson NJ, Marchini J, Soranzo N. Improved imputation of low-frequency and rare variants using the UK10K haplotype reference panel. Nature Communications. 2015 Sep 14;6:8111

  8. Huang J#,. Genome-wide association study for circulating levels of PAI-1 provides novel insights into its regulation. Blood. 2012 Dec 6;120(24):4873-81.

  9. Huang J#, Johnson AD, O'Donnell CJ. PRIMe: a method for characterization and evaluation of pleiotropic regions from multiple genome-wide association studies. Bioinformatics. 2011 May 1;27(9):1201-6.

  10. Huang J#, Perlis RH, Lee PH, Rush AJ, Fava M, Sachs GS, Lieberman J, Hamilton SP, Sullivan P, Sklar P, Purcell S, Smoller JW. Cross-disorder genomewide analysis of schizophrenia, bipolar disorder, and depression. American Journal of Psychiatry. 2010 Oct;167(10):1254-63.


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